Una de las diferencias que más destacan en la versión remasterizada del clásico Pokémon Mundo misterioso: Equipo de Rescate Rojo y Azul son la incorporación de las Mega evoluciones en una gran amplia lista de Pokémon.
La Megaevolución se trata de una manera de evolución, presente en los juegos de sexta y septima generación, a través de la cual un Pokémon puede alcanzar mayores poderes e ir más allá de los límites durante un corto periodo de tiempo.
Dentro del juego existen 41 formas mega evolutivas posibles.
En Pokémon Mundo misterioso: Equipo de rescate DX puedes utilizar la Megaevolucón gracias a la Semilla Plétora. Cuando un Pokémon consume la semilla entra en estado frenético, si el Pokémon tiene mega megaevolucionará. Esta semilla puede ser obtenida en mazmorras o como recompensa a través de completar misiones. 
